Сейшелы лежат севернее зоны мощных ураганов, ежегодно обрушивающихся на Мадагаскар и Маврикий. Но на островах до сих пор помнят, как в октябре 1862 года какой-то «заблудившийся» тайфун ударил по Маэ. Страшные ветры, невиданные проливные дожди вызвали огромные опустошения в горах, 1каменно-грязевые потоки устремились на столицу, снося все на своем пути. Об этом грозном разгуле стихии, унесшей около сотни человеческих жизней, со страхом рассказывают и сейчас, приписывая случившуюся катастрофу гневу сверхъестественных сил.
Двадцать лет спустя острова опустошила эпидемия черной оспы. Число жертв было куда больше, чем при памятном урагане... Постепенно менялся административный статут этого колониального владения Великобритании. До 1872 года они полностью управлялись с Маврикия, а затем Сейшелам была дана автономия в финансовых делах, а их управитель получил чин главного гражданского комиссара. С 1889 года он уже именовался администратором, и появился местный Законодательный совет, правда не с выборными, а с назначаемыми членами. В этот же период был образован и католический епископат.
Росли связи архипелага с внешним миром. В 1890 году вышли первые почтовые марки Сейшельских островов с традиционным профилем королевы Виктории. Три года спустя подводные кабели, пересекшие Индийский океан, достигли Маэ. Самостоятельной коронной колонией, не связанной подчинением Маврикию, Сейшелы стали лишь в августе 1903 года. Сэр Эрнст Бикхэм Суит-Эскорт стал первым губернатором, а всего их до 1976 года было в колонии восемнадцать.